Новый вариант вируса SARS-CoV-2 — более заразный?

06 Липня 2020 5:40 Поділитися

Авторы из США и Великобритании по результатам исследования представили новые данные об изменениях аминокислотного состава спайк-протеина вируса SARS‑CoV-2 (Korber B., et al. 2020). Так, вариант D614G, возникший в начале пандемии, постепенно вытесняется новым типом — G614, на многих географических уровнях: национальном, региональном, муниципальном (рисунок). Этот сдвиг наблюдают даже в локальных вспышках, где твердо установлен факт циркуляции варианта D614G. Является ли это результатом естественного отбора, и каковы последствия такого изменения фенотипа вируса для хода пандемии COVID-19? Авторы не дали исчерпывающих ответов на данные вопросы, но предложили свои наблюдения для последующего обсуждения. Так, после появления SARS-CoV-2 в Китае в конце 2019 г. и быстрого распространения пандемии COVID-19 в 2020 г. вопросы об эволюции вируса остаются нерешенными, отметили эксперты, присоединившиеся к дискуссии со страниц журнала «Cell» (Grubaugh, N.D., et al., 2020). Стал ли SARS-CoV-2 лучше приспособленным к функционированию в организме человека, более вирулентным или патогенным, более смертоносным?

РИСУНОК
Увеличение доли последовательностей, несущих мутацию D614G в каждом из регионов, который был хорошо представлен в базе данных GISAID в течение марта; гистограммы, иллюстрирующие относительные частоты исходной формы, Ухань (D614, оранжевый) и впервые появившейся в Европе (G614, синий); представлены фактические результаты, а не частоты, поэтому высота столбцов представляет размер выборки; глобальная картина представленности двух форм; размер круга представляет выборку

Вирусные мутации могут учащаться из-за естественного отбора, случайного генетического дрейфа или особенностей инфицированной популяции. Поскольку эти силы могут работать сочетанно, зачастую трудно понять, является ли распространение той или иной мутации случайным событием или развивается в рамках приспособления? Еще сложнее определить, изменит ли одна мутация ход эпидемиологического процесса.

Поскольку новый вариант спайк-протеина G614 имеет тенденцию к широкому распространению, это может означать его лучшую приспособленность к организму хозяина. Исследователи установили, что титр варианта G614 нарастает за счет псевдотипированных вирионов (Korber B., et al. 2020). У людей, инфицированных типом G614, наблюдают более низкие пороги циклов полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией , что свидетельствует о более высокой вирусной нагрузке в верхних дыхательных путях, хотя это и не связано с повышенной тяжестью заболевания. Авторы также предположили, что быстрое распространение G614 вызвано его большей заразностью по сравнению с D614. Полученные ими результаты, похоже, подтверждаются данными других ученых (Hu J., et al., 2020; Lorenzo-Redondo R., et al., 2020; Ozono S., et al., 2020; Wagner C., et al., 2020).

Тем не менее, эти данные не доказывают большую инфекционность или трансмиссибельность G614 по сравнению с вирусами, содержащими D614. Таким образом, остается много вопросов о потенциальных последствиях, которые D614G оказывает на пандемию COVID-19.

Список использованной литературы

1. Grubaugh N.D., Hanage W.P., Rasmussen, A.L. (2020) Making sense of mutation: what D614G means for the COVID-19 pandemic remains unclear, Cell, doi: https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.040.
2. Hu, J., He, C.-L. et al. (2020). The D614G mutation of SARS-CoV-2 spike protein enhances viral infectivity and decreases neutralization sensitivity to individual convalescent sera. bioRxiv 2020.06.20.161323.
3. Korber B, Fischer W., et al. (2020) on behalf of the Sheffield COVID-19 Genomics Group, Tracking changes in SARS-CoV-2 Spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 virus, Cell, doi: https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043.
4. Lorenzo-Redondo R., Nam H.H. et al. (2020). A Unique Clade of SARS-CoV-2 Viruses is Associated with Lower Viral Loads in Patient Upper Airways. medRxiv.
5. Ozono S., Zhang Y. et al. (2020). Naturally mutated spike proteins of SARS-CoV-2 variants show differential levels of cell entry. bioRxiv 2020.06.15.151779.
6. Wagner, C., Roychoudhury et al. (2020). Comparing viral load and clinical outcomes in Washington State across D614G mutation in spike protein of SARS-CoV-2. https://github.com/blab/ncov-D614G.
По материалам cell.com; sciencedirect.com; cov.lanl.gov

Коментарі

Коментарі до цього матеріалу відсутні. Прокоментуйте першим

Добавить свой

Ваша e-mail адреса не оприлюднюватиметься. Обов’язкові поля позначені *

*

Останні новини та статті