По данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), выздоровление после инфекции SARS-CoV-2 не защищает от заражения новым вариантом. «Мы думаем, что перенесенная ранее инфекция не защищает от «омикрон», — заявила инфекционист Анне фон Готтберг (Anne von Gottberg) из Южноафриканского национального института инфекционных заболеваний (National Institute for Communicable Diseases — NICD) 2 декабря на пресс-конференции Регионального африканского бюро ВОЗ.
Эксперты NICD и других научно-исследовательских организаций Южной Африки и Канады опубликовали препринт (2-я версия датирована 2 декабря) с ретроспективным анализом данных рутинного эпиднадзора и тестирования на SARS-CoV-2 в период с марта 2020 г. по 27 ноября 2021 г. (Juliet R.C. et al., 2021). Авторы сообщают, что расчетное соотношение рисков реинфекции в период с 1 ноября 2021 г. по 27 ноября 2021 г. по сравнению с первичной инфекцией в 1-ю волну составило 2,39 (95% ДИ 1,88–3,11). По заключению исследователей, на основании популяционных данных можно предположить, что вариант «омикрон» связан со значительной способностью уклоняться от постинфекционного иммунитета. В то время как не существует эпидемиологических свидетельств иммунного ускользания, связанного с «бета»- или «дельта»-вариантами, в масштабах всей популяции.
NICD также представил результаты генетического анализа выборки положительных результатов тестов на коронавирус, проведенных в ноябре. Из 249 секвенированных геномов 74% соответствовали варианту «омикрон». Поскольку около четверти южноафриканцев полностью вакцинированы, и значительная часть населения была инфицирована SARS-CoV-2 во время более ранних волн, ускорение инфекционного процесса в южноафриканском Гаутенге (в конце ноября, по расчетам NICD, репродуктивное число R было выше 2) подтверждает преимущество штамма «омикрон» в способности распространяться по сравнению с другими вариантами. Если такое развитие событий не повториться в других странах, это будет означать, что на инфекционный процесс сильно влияют другие факторы иммунологического ландшафта.
Четыре африканские страны, включая Южную Африку, Гану, Нигерию и Ботсвану, сообщили о выявлении случаев нового варианта. Уровень вакцинации в Африке очень низкий, и только 7% из 1,2 млрд жителей полностью вакцинированы от коронавируса. По данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) от 2 декабря, новый вариант вируса выявлен в 23 странах. Затем США стали 24-й страной, подтвердившей первый случай «омикрона». Он был выявлен у полностью вакцинированного человека в Калифорнии. Некоторые эпидемиологи предположили, что вариант «омикрон» мог начать распространяться по всему миру примерно в конце октября, сообщила «CNBC».
Защищает ли от «омикрон» эффект от предшествующей вакцинации, инфекции или введения специфических антител? Ученые со всего мира тщательно изучают этот вопрос. То, что эффективность подобной защиты будет снижена, можно предположить по результатам эксперимента, о котором сообщили в сентябре 2021 г. (Schmidt F. et al., 2021). Команда под руководством Пола Биениаша (Paul Bieniasz), вирусолога из Рокфеллеровского университета (Rockefeller University) в Нью-Йорке, протестировала сильно мутировавшую версию спайкового белка, который разделяет многочисленные мутации с «омикроном».
«Полимутантный спайк» оказался полностью устойчивым к нейтрализующим антителам большинства протестированных ранее болевших или вакцинированных от COVID-19. В то же время плазма людей, которые были инфицированы и впоследствии получили мРНК-вакцины, нейтрализовывала псевдовирусы, несущие высокорезистентный полимутантный спайк SARS-CoV-2. Недавняя ревакцинация, возможно, также поддерживает нейтрализацию вируса с помощью антител.
Как заключил данный исследовательский коллектив еще в сентябре 2021 г., 20 естественных мутаций в спайковом белке SARS-CoV-2 достаточно для создания псевдотипов с почти полной устойчивостью к поликлональным нейтрализующим антителам, вырабатываемым выздоравливающими людьми или реципиентами, получившими вакцину мРНК (Schmidt F., et al., 2021) . Для оценки эффективности иммунного ответа на новый вариант авторы использовали в том числе модель на основе вируса иммунодефицита человека 1-го типа с дефектом репликации, несущим псевдотипированный спайк SARS-CoV-2 (рисунок). Статья тех же авторов с описанием исследовательского подхода была опубликована еще в июле 2020 г. (Schmidt F. et al., 2020).
Усилить надзор за распространением нового варианта можно при помощи суррогатного теста, сообщает ВОЗ. В связи с несостоятельностью S-гена в качестве мишени для тестирования на «омикрон» при использовании широко распространенного теста (ThermoFisher TaqPath) этот признак можно использовать как маркер для выявления данного варианта. Тест ищет сегменты трех вирусных генов, один из которых является геном, кодирующим спайковый белок. Имеющиеся мутации препятствуют его выявлению, поэтому образцы, зараженные штаммом «омикрон», будут иметь положительный результат только по двум генам.
Список использованной литературы
Pulliam J.R.C., van Schalkwyk C., Govender N. et al. Increased risk of SARS-CoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa. medRxiv 2021.11.11.21266068; doi:
Schmidt F., Weisblum Y., Rutkowska M. et al. (2021) High genetic barrier to SARS-CoV-2 polyclonal neutralizing antibody escape. Nature.
Schmidt F., Weisblum Y., Mueckschet F. et al. (2020) Measuring SARS-CoV-2 neutralizing antibody activity using pseudotyped and chimeric viruses. J. Exp. Med. 217, e20201181 .
По материалам www.nature.com; www.cnbc.com; www.medrxiv.org; www.reuters.com
Коментарі
Коментарі до цього матеріалу відсутні. Прокоментуйте першим